Prof. Dr. Akay, 2003 yılında Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesinde akademik görevine başlamış, 2007 yılında doçent, 2013 yılında profesör unvanını almıştır. 2014 yılından itibaren Bursa Teknik Üniversitesi Orman Fakültesinde çalışmalarını sürdürmüş ve Orman Mühendisliği Bölüm Başkanlığı görevini yürütmüştür. Ayrıca, TÜBİTAK-TOVAG danışma kurulu üyeliği görevinde bulunmuştur. Bursa Teknik Üniversitesi Orman Fakültesindeki görevi süresince çok sayıda lisans ve lisansüstü öğrencinin yetişmesine katkı sağlamıştır.
Yaklaşık otuz yıllık akademik yaşamı boyunca Prof. Dr. Akay; orman yollarının planlanması, orman transportu, hassas ormancılık, coğrafi bilgi sistemleri, uzaktan algılama, LiDAR teknolojileri, insansız hava araçları, orman yangınları yönetimi, mekanizasyon ve ormancılık ergonomisi alanlarında çalışmalar yürütmüştür. Özellikle bilgisayar destekli orman yolu planlama sistemleri üzerine gerçekleştirdiği araştırmalar uluslararası literatürde önemli bir yer edinmiştir. Sekiz kitap bölümü, 134 uluslararası makale, 22 ulusal makale, 179 uluslararası bildiri ve 47 ulusal bildiri olmak üzere toplam 390 bilimsel yayına imza atmış; çalışmaları 4.000’in üzerinde atıf almıştır. Prof. Dr. Akay, 2022, 2023 ve 2024 yıllarında “Dünyanın En Etkili Bilim İnsanları” listesinde yer almış; uluslararası işbirlikleri ile Türkiye’de birçok akademisyenin yetişmesine ve kariyer gelişimine katkı sağlamıştır. Ayrıca, European Journal of Forest Engineering dergisinin kurucu ortaklarından biri olarak baş editörlük görevini yürütmüştür. Yetiştirdiği öğrenciler, kurduğu uluslararası araştırma ağları ve gerçekleştirdiği bilimsel çalışmalarla Türk ormancılığına kalıcı katkılar sunan Prof. Dr. Abdullah Emin Akay, 18 Ocak 2026 tarihinde ani bir kalp krizi sonucu aramızdan ayrılmıştır.